از نظر پایگاه اطلاعرسانی دولت، شمخانی مسئول پرونده هستهای است و از نظر وزارت خارجه، این مسئولیت بر عهده وزیر خارجه یعنی عراقچی است. هنوز مشخص نیست در این اختلاف، در نهایت حق با چه کسی است.
یک فعال سیاسی اصولگرا گفت: آقای شمخانی همیشه پشت پرده حضور داشته و پشت پرده تصمیم گرفته و هیچوقت هم شفاف صحبت نکرده و حرف نزده است. الان هم که مثلا آمده و شفاف حرف میزند اتهاماتی را به دیگران وارد میکند و باید منتظر باشد تا پاسخ خود را از دیگران بشنود.
دبیر سابق شورای عالی امنیت ملی گفت: وقتی گروسی، دبیرکل آژانس بین المللی به ایران آمد، خیلی توافقات خوبی با او انجام شد، گروسی هم خیلی تلاش کرد. ما در مورد هیچ چیزی قول توقف ندادیم اما قول عدم انباشت دادیم که توقف با عدم انباشت متفاوت هستند.
سردار شریف سخنگوی سابق سپاه گفت: آن روز در حال رفتن به زنجان برای سخنرانی روز قدس بودم که فردی از دبیرخانه شورای عالی امنیت ملی تماس گرفت که آقای شریف چه کار کردید! گفتم چطور؟ گفت آقای ظریف از هتل کوبورگ تماس گرفتند و گفتند اظهارات ایشان تمام بساط ما را به هم
یک منبع نزدیک به دریابان شمخانی مشاور سیاسی مقام معظم رهبری نقل قول ذکر شده از سوی علیرضا زاکانی کاندیدای ریاست جمهوری از شمخانی در موضوع پرونده برجام را تکذیب کرد
دريابان «علي شمخاني»، نماينده مقام معظم رهبري و دبير شوراي عالي امنيت ملي، به پرسشهاي مطرحشده درباره دلايل خروج آمريكا از برجام، سياستهاي منطقهاي ايران و دلايل حضور مستشاران نظامي کشورمان در عراق و سوريه، تحولات امنيتي منطقه بهويژه موضوع انتقال سفارت