سردار دهقان موضوع امنیتی در این باره را احتمال"رخنه" دانست و گفت: «اینکه چرا این اتفاق افتاد، باید از این منظر سوال شود که چرا اشراف اطلاعاتی و امنیتی که در سطح ملی امروز داریم یک جاهایی در آن رخنه صورت می‌گیرد و امکان چنین عملیاتی در کشور به وجود می‌آید.»
او تاکید کرد: "این که از کجا این رخنه و نفوذ صورت می‌گیرد را مقامات مسئول باید جواب دهند."
محسن رضایی فرمانده پیشین سپاه نیز در نامه‌ای در این رابطه خطاب به حسن روحانی نوشته است: "سازمانهای اطلاعاتی کشور موکداً موظف شوند که منابع اصلی و نفوذی های سازمانهای جاسوسی را شناسایی نمایند و شیوه های شکل گیری تیم های ترور و سرپل های همکاری آنها با یکدیگر را کشف و خنثی کنند."
او تاکید کرد: "پر واضح است که ادامه چنین اقدامات تروریستی نشانگر ضعف سازمان های اطلاعاتی کشور خواهد بود که باید با همتی مضاعف به آن پایان داده شود."
![نفوذ و رخته امنیتی در ترور شهید فخریزاده؟]( "نفوذ و رخته امنیتی در ترور شهید فخریزاده؟")
اعتراض شبانه به دولت در پاستور
همچنین روزنامه جوان وابسته به سپاه پاسداران در گزارش امروز خود به این موضوع اشاره کرده است.
اعتراض شبانه به دولت در پاستور این روزنامه نوشت: "یک روز پس از مبادله یک جاسوس انگلیسی - استرالیایی وابسته به رژیم صهیونیستی و درست در شب سالگرد شهادت شهید مجید شهریاری در ۸ آذر ۸۹، رئیس سازمان پژوهش و نوآوری وزارت دفاع و پشتیبانی نیرو‌های مسلح که از سال‌ها پیش در لیست ترور سازمان جاسوسی موساد قرار گرفته بود، ترور شد و به شهادت رسید، تا بار دیگر حفره‌های اطلاعاتی و امنیتی نمایان شود و علامت سؤال بزرگی را مقابل بی‌عملی دستگاه‌های امنیتی قرار دهد!"
این اولین بار نیست احتمال نفوذ و رخنه امنیتی در راستای ترور و خرابکاری در کشور مطرح می‌شود. تابستان امسال مرکز تولید سانتریفیوژ نطنز هدف اقدامی خرابکارانه قرار گرفت، پیش از آن نیز درباره ترور شهید سلیمانی در فرودگاه بغداد این مسائل مطرح بود.
البته عده‌ای مسئله نفوذ را در نهادهای امنیتی ارزیابی نمی کنند و ایراد را در اقدامات دولت می دانند.
کریمی قدوسی نماینده مشهد نیز از همین زاویه در توئیتی نوشت: "جناب روحانی در زمان ریاست شما بر قوه مجریه و با اصرار دشمن و تاکید شخص جنابعالی دانشمند هسته‌ای کشورمان دکتر محسن فخری زاده با آمانو ملاقات داده شد، قطعا روزی باید در محکمه عدالت پاسخگو باشید که این چنین راحت سرمایه‌های کشور را در دسترس جاسوسان و قاتلان موساد قرار دادید."
البته این ادعا از سوی سایت "رجانیوز" نزدیک به جبهه پایداری تکذیب شد. اما این روایت که اقدامات دولت باعث افشار اطلاعات دانشمندان هسته ای شده در میان طیفی از اصولگرایان به شکل قوی مطرح است.
