پس از این مسابقه در میان انتقاد از عملکرد بازیکنان استقلال، سید حسین حسینی به عنوان سنگربان در صف اول قرار داشت و روی دو گلی که این بازیکن دریافت کرد در فضای مجازی علیه او موضع‌گیری‌های تندی در پایان رقابت‌های یک فصل دشوار شکل گرفت.
حسینی پس از این بازی اعلام کرد که دلیل عملکرد نسبتا ضعیف او مقابل نماینده ازبکستان شکستگی در ناحیه دنده و احساس درد شدید بوده است. دروازه بان ملی پوش آبی‌ها همچنین اعلام کرد که با تزریق آمپول و با توجه به شرایط حساس تیمش در لیگ قهرمانان مهیای این بازی شد.
اظهارات حسینی، اما در همان روز از طریق سایت رسمی باشگاه تکذیب شد. دکتر کاوه ستوده وقت پزشک استقلال در خصوص مصدومیت سید حسین حسینی گفته بود: "حسینی در دیدار با الاهلی از ناحیه دنده دچار ضربه شد و از همین ناحیه احساس درد کرد. بعد از این ضربه هم اقدامات درمانی و پزشکی آغاز شد و کادر فنی هم به طور کامل در جریان شرایط این بازیکن قرار داشت. با تصویربرداری انجام شده، مشخص گردید حسینی از ناحیه دنده دچار شکستگی نشده است. با اقدامات انجام شده هم خود ایشان خواست به تیم کمک کند و برای بازی اعلام آمادگی کرد. "
ستوده با این اظهار نظر سبب دلخوری حسینی شد و شدت عصبانیت این بازیکن از پزشک تیم تا جایی بالا گرفت که زمان بازگشت کاروان استقلال به ایران در فرودگاه دوحه اتفاقات عجیبی رخ داد. حسینی در فرودگاه به اظهارات ستوده واکنش نشان می‌دهد و درگیری لفظی بین طرفین شدید می‌شود که با دخالت حاضرین مانع از درگیری فیزیکی این دو می‌شوند.
پس از بازگشت تیم استقلال به تهران و با گذشت چند هفته از این ماجرا، سید حسین حسینی به همراه فرشید اسماعیلی و محمد دانشگر به کمیته انضباطی باشگاه فراخوانده شدند و پس از تشکیل جلسه مشخص شد که آن‌ها با جریمه نقدی مواجه شده‌اند. جریمه نقدی این بازیکنان کافی نبود و وقتی در همین هفته کادر پزشکی تیم استقلال اعلام پایان همکاری کردند، حسینی مجددا مورد حمله در فضای مجازی قرار گرفت.
کاربران در سطح فضای مجازی مدعی شدند که اظهارات حسینی نادرست بوده و رفتار او با کادرپزشکی موجب شد تا آن‌ها به دنبال پایان همکاری باشند؛ موضوعی که کاسه صبر این دروازه‌بان را لبریز کرد تا او بالاخره به سکوتش درباره این ماجرا پایان بدهد. حسینی در استوری اینستاگرامش اعلام کرد با تزریق ۶ آمپول برای بازی با پاختاکور آماده شد و کادرپزشکی از این موضوع مطلع بودند؛ او همچنین گفته از طریق محمود فکری، سرمربی تیم خواستار صحبت کردن با کاوه ستوده و امین نوروزی هم شده است که با مخالفت آن‌ها رو به رو بود.
استوری حسینی در اینستاگرامش را مشاهده می‌کنید:
