۱. تعدد برنامه‌های معرفی شده از سوی بانک‌های مختلف و مردمی که باید چند برنامه برای یک امر واحد نصب کنند.
۲. عدم کاربری آسان برنامه‌های تولیدی و به دوش کشیدن بسیاری از بار‌های تبلیغاتی و سایر جنبه‌های بانکداری و درآمدزایی بانک‌ها توسط این برنامه‌ها! به نظر می‌رسد تا قبل از ابلاغ اجرای این طرح به بانک‌ها، بانک مرکزی و وزارت ارتباطات باید نسبت به حل این دو مشکل چاره اندیشی کنند!
برای مثال: طراحی یک application واحد برای تمام بانک‌ها و موسسات مالی و اعتباری، برنامه‌ای مثل google authenticat که در عین سادگی و کارآمدی، دقیقا عمل تولید تولید رمز پویا که به twostep verification معروف است، انجام می‌دهد. البته با گشتی در سایت‌هایی مثل بازار و مایکت، برنامه‌هایی برای این امر کم و بیش وجود دارد، ولی با توجه به حساسیت موضوع، بهتر است توسط نهاد‌های بالا دستی اقدامی صورت گیرد، همیشه اعتماد به شرکت‌های ثانویه و وابسته اولویت اول نیست!
